中國民航局20日發布《“3·21”東航MU5735航空器飛行事故調查初步報告》情況通報，對於廣受公眾關注的飛機維修和航司人員等環節，《初步報告》給出了“符合要求”、“未見異常”的信息，並表示後續將依據相關程序繼續深入開展殘骸識別、分類及檢查、飛行數據分析、必要的實驗驗證等調查工作，科學嚴謹查明事故原因。
河南航空業協會專家委員會秘書長喬善勛20日對《環球時報》記者表示，航空事故的初步調查報告內容是調查人員收集到的事實情況，不包含空難的分析和結論。公眾急於了解的事故原因，會在最終的報告中體現。路透社20日稱，空難事故的最終報告可能需要一年或更長時間才能完成。
4月20日是“3·21”東航MU5735航空器飛行事故發生后的第30天。根據《國際民用航空公約》規定，在事故之日起30天內，調查組織國須向國際民航組織（ICAO）和參與調查國發送調查初步報告，其內容通常為當前所獲取的事實信息，不包括事故原因分析及結論。據外媒報道，中方已向ICAO發送了初步報告。此外，因為涉事飛機是在美國製造的，報告也將發給美國。
民航局20日發布的情況通報指出，目前《初步報告》已完成，報告主要包括飛行經過、機組機務人員、適航維修、殘骸分佈等事實信息。
飛機於北京時間13:16從昆明長水機場21號跑道起飛，13:27上升至巡航高度8900米，14:17沿A599航路進入廣州管制區，14:20:55廣州區域管制雷達出現“偏離指令高度”告警，飛機脫離巡航高度，管制員隨即呼叫機組，但未收到任何回復。14:21:40雷達最後一次記錄的飛機信息為：標準氣壓高度3380米，地速1010千米/小時，航向117度。隨後，雷達信號消失。
經調查，當班飛行機組、客艙機組和維修放行人員資質符合要求；事故航空器適航證件有效，飛機最近一次A檢（31A）及最近1次C檢（3C）未超出維修方案規定的檢查時限，當天航前和短停放行無故障報告，無故障保留；機上無申報為危險品的貨物；此次飛行涉及的航路沿途導航和監視設施、設備未見異常，無危險天氣預報；在偏離巡航高度前，機組與空管部門的無線電通信和管制指揮未見異常，最後一次正常陸空通話的時間為14:16；機上兩部記錄器由於撞擊嚴重受損，數據修復及分析工作仍在進行中。
香港《南華早報》近日報道稱，澳大利亞交通安全局已退休的飛機事故調查員哈特利表示，空難的初步調查報告基於撰寫報告時可獲得的已核實信息，其特點是沒有分析、沒有結論。來自空管機構的音頻和雷達等電子數據很容易核實。但由於黑匣子可能在事故中受損，其數據需要由專家解碼，專家將驗證數據的完整性。初步調查報告將只有幾頁長。如2014年失蹤的馬來西亞航空公司MH370航班，其初步調查報告只有5頁。香港工程師學會飛機部門發言人Warren Chim Wing-nin表示，初步調查報告很薄，而“最終報告可能有100頁或200頁”。